南京海光应用化学研究所成立于一九九二年九月，隶属于南京奥赛康医药集团有限公司，是奥赛康药业发展的基础与源泉，国内较早的非公有制企业之一。研究所是主要从事新药研究开发的综合性药物研究机构，全所现有科技人员51人，主要由具有药学、医学和相关专业的技术人员组成。 　　研究所包括：天然药物化学室，合成药物化学室，制剂室，分析化学室，药理室，中试室，临床办公室，药品注册办公室以及图书情报室等机构。 　　南京海光应用化学研究所是以创新药物、仿制药物和应用化学开发研究为主体的综合性研究所，通过生物学和化学两大学科的密切合作，阐明生物活性物质的结构、活性及这两者的关系，完成新药的应用基础研究、临床前应用开发研究和产业化的相关研究。研究所的重点学科和研究领域是：天然产物化学、药物合成化学、新药筛选(包括大规模高通量筛选、新靶点探索和新模型建立)、药理学等。近年来还着力加强和发展了药物制剂学、药物质量控制和组合化学等学科及研究领域。 　　通过以上各学科紧密配合，重点研究消化系统药物、缓肿瘤药物、心血管系统药物、抗生素药物、抗菌药物、抗病毒药物和呼吸系统药物的研究和开发;近年来并进一步重视传统中草药的研究开发，成立了天然药物研究室。 　　南京海光应用化学研究所为国内较早开展新药研究的民营研究所。十几年来，共研制出60多种药物投入生产，其中包括一些国内首先开发的剂型和品种，如口腔粘附片、外用凝胶剂等，品种有奥美拉唑静滴剂，昂丹司琼冻干粉针等，并有多项技术获得或将获得国家专利。到2003年底为止我们已获得52项新药证书，由SFDA颁发的临床批件有26个，已在SFDA注册的临床前研究的品种有26个。